认定时间：2001/6/1
上级批准部门：北京市教委/北京市科委
农业应用新技术北京市重点实验室是由北京市教育委员会和北京市科学技术委员会于2001年首批联合认定的北京市重点实验室。依托单位是北京农学院，是相对独立的科研实体。实验室实行学术委员会指导下的主任负责制，姚允聪教授担任实验室主任，中国工程院院士方智远教授担任实验室学术委员会主任。
实验室总体定位是应用研究和应用基础研究，重点研究方向为：开展植物遗传改良、种质创新与利用；果实发育与调控；高新生物技术研究。目标是将重点实验室建设成国内一流的科学研究、人才培养、学术交流与国际合作基地。
实验室现有研究人员50余名，专职管理和技术人员5名，其中高级专业技术职称人员占70%，博士学位研究人员占60%。实验室现有使用面积1300平方米，仪器设备先进，仪器设备200余台（套），设备总值近2000万元，其中10万元以上仪器设备20余台。所有仪器设备实行专管共用，面向全校及社会开放。